Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM227AF5H4B4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM227AF5H4B4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM227AF5H4B4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms