Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPIPA5E9PKD4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NPIPA5E9PKD4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms