Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC10BA6NIK2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC10BA6NIK2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms