Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
USP17L3A6NCW0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP17L3A6NCW0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP17L3A6NCW0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP17L3A6NCW0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms