Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
UBE2V1Q13404 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms