RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434353.6

CXorf40A-208, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-208ENST00000434353 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.9■■■■■ 4.78
CXorf40A-208ENST00000434353 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.67■■■■□ 3.94
CXorf40A-208ENST00000434353 ABCC9O60706 1549 aa38.41■■■■□ 3.74
CXorf40A-208ENST00000434353 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.59
CXorf40A-208ENST00000434353 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.39■■■■□ 3.58
CXorf40A-208ENST00000434353 NACADO15069 1562 aa37.18■■■■□ 3.54
CXorf40A-208ENST00000434353 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.12■■■■□ 3.53
CXorf40A-208ENST00000434353 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.12■■■■□ 3.53
CXorf40A-208ENST00000434353 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.08■■■■□ 3.53
CXorf40A-208ENST00000434353 SCRIBQ14160 1630 aa36.32■■■■□ 3.41
CXorf40A-208ENST00000434353 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.31■■■■□ 3.4
CXorf40A-208ENST00000434353 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.98■■■■□ 3.35
CXorf40A-208ENST00000434353 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.35
CXorf40A-208ENST00000434353 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.88■■■■□ 3.33
CXorf40A-208ENST00000434353 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35■■■■□ 3.19
CXorf40A-208ENST00000434353 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.95■■■■□ 3.19
CXorf40A-208ENST00000434353 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
CXorf40A-208ENST00000434353 SMARCA4P51532 1647 aa34.75■■■■□ 3.15
CXorf40A-208ENST00000434353 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.75■■■■□ 3.15
CXorf40A-208ENST00000434353 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.73■■■■□ 3.15
CXorf40A-208ENST00000434353 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.64■■■■□ 3.14
CXorf40A-208ENST00000434353 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.41■■■■□ 3.1
CXorf40A-208ENST00000434353 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
CXorf40A-208ENST00000434353 SMARCA2P51531 1590 aa34.39■■■■□ 3.1
CXorf40A-208ENST00000434353 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.35■■■■□ 3.09
CXorf40A-208ENST00000434353 WIZO95785 1651 aa34.31■■■■□ 3.08
CXorf40A-208ENST00000434353 NCAPD3P42695 1498 aa34.28■■■■□ 3.08
CXorf40A-208ENST00000434353 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
CXorf40A-208ENST00000434353 HMGXB3Q12766 1538 aa34.18■■■■□ 3.06
CXorf40A-208ENST00000434353 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
CXorf40A-208ENST00000434353 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
CXorf40A-208ENST00000434353 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.54■■■□□ 2.96
CXorf40A-208ENST00000434353 NESP48681 1621 aa33.38■■■□□ 2.93
CXorf40A-208ENST00000434353 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.34■■■□□ 2.93
CXorf40A-208ENST00000434353 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.33■■■□□ 2.93
CXorf40A-208ENST00000434353 CFTRP13569 1480 aa33.24■■■□□ 2.91
CXorf40A-208ENST00000434353 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.08■■■□□ 2.89
CXorf40A-208ENST00000434353 ERCC6Q03468 1493 aa33.06■■■□□ 2.88
CXorf40A-208ENST00000434353 PRDM2Q13029 1718 aa33.05■■■□□ 2.88
CXorf40A-208ENST00000434353 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33■■■□□ 2.87
CXorf40A-208ENST00000434353 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.98■■■□□ 2.87
CXorf40A-208ENST00000434353 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.9■■■□□ 2.86
CXorf40A-208ENST00000434353 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
CXorf40A-208ENST00000434353 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.73■■■□□ 2.83
CXorf40A-208ENST00000434353 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.62■■■□□ 2.81
CXorf40A-208ENST00000434353 WDR62O43379 1518 aa32.59■■■□□ 2.81
CXorf40A-208ENST00000434353 ABCC8Q09428 1581 aa32.53■■■□□ 2.8
CXorf40A-208ENST00000434353 TOPBP1Q92547 1522 aa32.51■■■□□ 2.79
CXorf40A-208ENST00000434353 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.51■■■□□ 2.79
CXorf40A-208ENST00000434353 CUX2O14529 1486 aa32.46■■■□□ 2.79
CXorf40A-208ENST00000434353 CUX1P39880 1505 aa32.46■■■□□ 2.79
CXorf40A-208ENST00000434353 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.44■■■□□ 2.78
CXorf40A-208ENST00000434353 SYNJ1O43426 1573 aa32.35■■■□□ 2.77
CXorf40A-208ENST00000434353 TOP2BQ02880 1626 aa32.31■■■□□ 2.76
CXorf40A-208ENST00000434353 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.3■■■□□ 2.76
CXorf40A-208ENST00000434353 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.28■■■□□ 2.76
CXorf40A-208ENST00000434353 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
CXorf40A-208ENST00000434353 IFT140Q96RY7 1462 aa32.16■■■□□ 2.74
CXorf40A-208ENST00000434353 SOGA1O94964 1423 aa32.14■■■□□ 2.74
CXorf40A-208ENST00000434353 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.14■■■□□ 2.74
CXorf40A-208ENST00000434353 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
CXorf40A-208ENST00000434353 TRIM41Q8WV44 630 aa32.05■■■□□ 2.72
CXorf40A-208ENST00000434353 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
CXorf40A-208ENST00000434353 WDR97A6NE52 1622 aa31.97■■■□□ 2.71
CXorf40A-208ENST00000434353 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.97■■■□□ 2.71
CXorf40A-208ENST00000434353 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.96■■■□□ 2.71
CXorf40A-208ENST00000434353 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
CXorf40A-208ENST00000434353 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
CXorf40A-208ENST00000434353 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.89■■■□□ 2.7
CXorf40A-208ENST00000434353 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.8■■■□□ 2.68
CXorf40A-208ENST00000434353 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.78■■■□□ 2.68
CXorf40A-208ENST00000434353 KIF27Q86VH2 1401 aa31.71■■■□□ 2.67
CXorf40A-208ENST00000434353 PBRM1Q86U86 1689 aa31.71■■■□□ 2.67
CXorf40A-208ENST00000434353 GRIN2BQ13224 1484 aa31.7■■■□□ 2.66
CXorf40A-208ENST00000434353 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.62■■■□□ 2.65
CXorf40A-208ENST00000434353 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.62■■■□□ 2.65
CXorf40A-208ENST00000434353 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.58■■■□□ 2.65
CXorf40A-208ENST00000434353 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.55■■■□□ 2.64
CXorf40A-208ENST00000434353 IGF1RP08069 1367 aa31.5■■■□□ 2.63
CXorf40A-208ENST00000434353 ADAMTS12P58397 1594 aa31.47■■■□□ 2.63
CXorf40A-208ENST00000434353 FBLN2P98095 1184 aa31.44■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 SYNJ2O15056 1496 aa31.43■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.42■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 EEA1Q15075 1411 aa31.42■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 CHD1O14646 1710 aa31.42■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 CUL7Q14999 1698 aa31.41■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
CXorf40A-208ENST00000434353 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.34■■■□□ 2.61
CXorf40A-208ENST00000434353 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.33■■■□□ 2.61
CXorf40A-208ENST00000434353 GRIN2AQ12879 1464 aa31.31■■■□□ 2.6
CXorf40A-208ENST00000434353 OSCARQ8IYS5 282 aa31.23■■■□□ 2.59
CXorf40A-208ENST00000434353 PRXQ9BXM0 1461 aa31.22■■■□□ 2.59
CXorf40A-208ENST00000434353 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.22■■■□□ 2.59
CXorf40A-208ENST00000434353 CEP170Q5SW79 1584 aa31.14■■■□□ 2.58
CXorf40A-208ENST00000434353 NUP160Q12769 1436 aa31.12■■■□□ 2.57
CXorf40A-208ENST00000434353 KIF21BO75037 1637 aa31.09■■■□□ 2.57
CXorf40A-208ENST00000434353 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.04■■■□□ 2.56
CXorf40A-208ENST00000434353 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.03■■■□□ 2.56
CXorf40A-208ENST00000434353 GOLGA3Q08378 1498 aa30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms