Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSTAP01040 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSTAP01040 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms