Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SEMA4FO95754 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms