Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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