Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD47Q08722 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD47Q08722 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD47Q08722 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CD47Q08722 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD47Q08722 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CD47Q08722 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms