Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TRPC1P48995 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms