Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MKLN1Q9UL63 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MKLN1Q9UL63 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.6 ms