Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms