Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms