Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACVR1BP36896 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms