Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LIMD2Q9BT23 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
LIMD2Q9BT23 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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