Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KCNMB4Q86W47 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms