Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BNIP1Q12981 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms