Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBXN1Q04323 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBXN1Q04323 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms