Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EEFSECP57772 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms