Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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