Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRIM8Q9BZR9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms