Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 DYRK1A-205ENST00000426672 519 ntTSL 55.32□□□□□ -1.563e-6■■□□□ 12.2
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GTF2F1P35269 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.574e-7■■□□□ 12.1
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GTF2F1P35269 SMAP2-203ENST00000435168 666 ntTSL 57.53□□□□□ -1.23e-8■■□□□ 12
GTF2F1P35269 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.486e-9■■□□□ 12
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GTF2F1P35269 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-15■■□□□ 12
GTF2F1P35269 BAHD1-202ENST00000560846 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-15■■□□□ 12
GTF2F1P35269 BAHD1-201ENST00000416165 4526 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.33e-15■■□□□ 12
GTF2F1P35269 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.521e-6■■□□□ 12
GTF2F1P35269 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.461e-6■■□□□ 12
GTF2F1P35269 AGAP3-209ENST00000469901 582 ntTSL 322.22■■□□□ 1.151e-6■■□□□ 12
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GTF2F1P35269 MFSD12-203ENST00000398558 1014 ntTSL 221.34■■□□□ 1.012e-6■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.675e-6■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 UBXN6-209ENST00000592515 403 ntTSL 514.04□□□□□ -0.165e-6■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 YES1-204ENST00000581960 487 ntTSL 327.97■■■□□ 2.074e-7■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 YES1-202ENST00000577611 568 ntTSL 422.46■■□□□ 1.194e-7■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 TRIM13-203ENST00000378183 1251 ntTSL 222.37■■□□□ 1.174e-7■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.724e-7■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 TRIM13-208ENST00000478111 478 ntTSL 219.02■□□□□ 0.644e-7■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.624e-7■■□□□ 11.9
GTF2F1P35269 DECR1-209ENST00000519410 705 ntTSL 518.65■□□□□ 0.584e-7■■□□□ 11.9
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