Protein–RNA interactions for Protein: P01009

SERPINA1, Alpha-1-antitrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA1P01009 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SERPINA1P01009 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms