Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C1orf109Q9NX04 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C1orf109Q9NX04 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms