Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACADSP16219 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACADSP16219 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ACADSP16219 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms