Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TBCCD1Q9NVR7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms