Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-206ENST00000431212 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.651e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-203ENST00000357895 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 CSDE1-217ENST00000534699 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 CSDE1-212ENST00000529046 571 ntTSL 48.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 CSDE1-209ENST00000525132 521 ntTSL 54.8□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 514.41□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1-206ENST00000419074 997 ntTSL 514.28□□□□□ -0.125e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 513.87□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.425e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 139.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.967e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC61-206ENST00000596687 800 ntTSL 526.64■■□□□ 1.867e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC61-207ENST00000599044 849 ntTSL 224.35■■□□□ 1.497e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.147e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-MEF2B-201ENST00000354191 1695 ntTSL 220.5■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-MEF2B-207ENST00000602804 1804 ntTSL 219.6■□□□□ 0.737e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.677e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.67e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-MEF2B-208ENST00000630940 1664 ntTSL 217.87■□□□□ 0.457e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 MEIOB-207ENST00000496541 807 ntTSL 526.07■■□□□ 1.765e-9■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.675e-9■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.475e-9■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.175e-9■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.255e-9■■■■■ 139.2
UTP3Q9NQZ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.612e-6■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 DNTTIP1-205ENST00000456939 1073 ntTSL 521.58■■□□□ 1.054e-19■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.024e-19■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.111e-21■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.21e-21■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 DNTTIP1-204ENST00000449078 473 ntTSL 212.27□□□□□ -0.454e-19■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.768e-11■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.688e-11■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.198e-11■■■■■ 139.1
UTP3Q9NQZ2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.699e-8■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.219e-8■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-213ENST00000611549 4294 ntTSL 515.13■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-6■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-206ENST00000374765 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 RAP1GAP-212ENST00000542643 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 MKLN1-209ENST00000494785 2386 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.497e-9■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 FDXR-207ENST00000577932 572 ntTSL 220.53■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 139
UTP3Q9NQZ2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.796e-7■■■■■ 138.9
UTP3Q9NQZ2 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 219.92■□□□□ 0.786e-7■■■■■ 138.9
UTP3Q9NQZ2 ERAP1-204ENST00000503921 551 ntTSL 424.86■■□□□ 1.578e-7■■■■■ 138.9
UTP3Q9NQZ2 FAM49B-203ENST00000517672 548 ntTSL 58.29□□□□□ -1.085e-7■■■■■ 138.9
UTP3Q9NQZ2 FAM49B-213ENST00000519142 696 ntTSL 58.18□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 138.9
UTP3Q9NQZ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.182e-11■■■■■ 138.8
UTP3Q9NQZ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.52e-11■■■■■ 138.8
UTP3Q9NQZ2 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 220.84■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 138.7
UTP3Q9NQZ2 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)17.35■□□□□ 0.378e-7■■■■■ 138.7
UTP3Q9NQZ2 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.018e-7■■■■■ 138.7
UTP3Q9NQZ2 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-6■■■■■ 138.7
UTP3Q9NQZ2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 138.7
UTP3Q9NQZ2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.776e-8■■■■■ 138.7
UTP3Q9NQZ2 CR1L-204ENST00000530905 930 ntTSL 522.72■■□□□ 1.239e-7■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-210ENST00000540114 2645 ntTSL 216.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 ESRRB-203ENST00000507951 736 ntTSL 315.31■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-217ENST00000545381 1191 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 KDM4C-209ENST00000489243 1439 ntTSL 26.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 IRAK1-207ENST00000443220 1175 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 IRAK1-213ENST00000477274 705 ntTSL 513.67□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 138.6
UTP3Q9NQZ2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.47e-7■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.327e-7■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF846-211ENST00000592587 548 ntTSL 514.62□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF846-203ENST00000586814 482 ntTSL 514.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF846-207ENST00000589412 683 ntTSL 510.61□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF846-209ENST00000590471 427 ntTSL 39.43□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 ZNF846-204ENST00000587650 561 ntTSL 48.82□□□□□ -12e-6■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 38.63□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 138.5
UTP3Q9NQZ2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-6■■■■■ 138.4
UTP3Q9NQZ2 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 415.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 138.4
UTP3Q9NQZ2 BCL9L-204ENST00000530293 445 ntTSL 59.54□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 138.4
UTP3Q9NQZ2 PDE7A-206ENST00000519626 522 ntTSL 427.58■■■□□ 2.019e-10■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 PDE7A-205ENST00000519231 685 ntTSL 520.41■□□□□ 0.869e-10■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.259e-10■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 PDE7A-208ENST00000523253 572 ntTSL 49.48□□□□□ -0.899e-10■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.049e-10■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.675e-8■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN2-202ENST00000468311 408 ntTSL 224.44■■□□□ 1.55e-8■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.655e-7■■■■■ 138.3
UTP3Q9NQZ2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.311e-6■■■■■ 138.2
UTP3Q9NQZ2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 138.2
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1477 ms