Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms