Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SRSF6Q13247 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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