Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACSBG1Q96GR2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSBG1Q96GR2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSBG1Q96GR2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSBG1Q96GR2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACSBG1Q96GR2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms