Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTGDRQ13258 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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