Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K1Q13233 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K1Q13233 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms