Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 PPP1R12A-216ENST00000550510 631 ntTSL 54.04□□□□□ -1.761e-7■■□□□ 11.7
PRPF4O43172 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.17e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.285e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SEPT10-203ENST00000397714 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.395e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.45e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.445e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SEPT10-205ENST00000415095 1605 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.975e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SEPT10-211ENST00000468616 531 ntTSL 44.56□□□□□ -1.685e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SLC16A3-218ENST00000583444 2882 nt20.1■□□□□ 0.811e-7■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 212.64□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MLXIPL-211ENST00000488212 534 ntTSL 210.42□□□□□ -0.748e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 LRBA-212ENST00000514435 2140 ntTSL 213.63□□□□□ -0.236e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-223ENST00000498173 1589 ntTSL 221.75■■□□□ 1.073e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.033e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.863e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.83e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.773e-11■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 INTS11-221ENST00000496353 2428 ntTSL 218.87■□□□□ 0.613e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-235ENST00000527719 750 ntTSL 518.69■□□□□ 0.583e-11■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 INTS11-230ENST00000526332 579 ntTSL 417.98■□□□□ 0.473e-11■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 INTS11-218ENST00000488042 1134 ntTSL 217.04■□□□□ 0.323e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.33e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-207ENST00000434694 1056 ntTSL 516.89■□□□□ 0.293e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-237ENST00000530031 800 ntTSL 516.82■□□□□ 0.283e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-201ENST00000323275 2450 ntTSL 1 (best)16.8■□□□□ 0.283e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-210ENST00000458452 2571 ntTSL 216.77■□□□□ 0.273e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INTS11-233ENST00000527098 2004 ntTSL 216.55■□□□□ 0.243e-11■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 INTS11-231ENST00000526797 659 ntTSL 411.62□□□□□ -0.553e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 MTUS1-225ENST00000523718 3354 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.432e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.481e-19■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 UBR4-207ENST00000425413 2954 ntTSL 211.98□□□□□ -0.499e-7■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.681e-19■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.531e-19■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 518.33■□□□□ 0.528e-7■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.568e-15■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PICALM-215ENST00000531558 565 ntTSL 524.53■■□□□ 1.528e-15■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PICALM-218ENST00000532041 699 ntTSL 321.98■■□□□ 1.118e-15■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.368e-15■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.278e-15■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.26e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 PPP4R2-205ENST00000482242 771 ntTSL 325.29■■□□□ 1.641e-8■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.596e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.596e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.176e-6■■□□□ 11.6
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PRPF4O43172 Z97634.1-202ENST00000457760 1044 ntTSL 221.71■■□□□ 1.076e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.011e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 221.22■□□□□ 0.996e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.976e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-217ENST00000503420 580 ntTSL 421.04■□□□□ 0.961e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.941e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 NECAB3-221ENST00000607055 554 ntTSL 420.84■□□□□ 0.934e-11■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 ZNF202-204ENST00000528306 552 ntTSL 420.77■□□□□ 0.926e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.866e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PIDD1-209ENST00000531286 1937 ntTSL 220.02■□□□□ 0.86e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 VPS53-210ENST00000571456 744 ntTSL 319.65■□□□□ 0.741e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.726e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-206ENST00000448141 664 ntTSL 319.51■□□□□ 0.711e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 PIEZO1-209ENST00000490756 446 ntTSL 319.45■□□□□ 0.76e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-209ENST00000455279 676 ntTSL 419.21■□□□□ 0.671e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-224ENST00000507829 589 ntTSL 419.18■□□□□ 0.661e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.646e-6■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-226ENST00000508683 567 ntTSL 419.02■□□□□ 0.641e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-228ENST00000509552 2304 ntTSL 1 (best)18.86■□□□□ 0.611e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-207ENST00000448162 699 ntTSL 518.82■□□□□ 0.61e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-218ENST00000503934 560 ntTSL 518.81■□□□□ 0.61e-8■■□□□ 11.6
PRPF4O43172 CCHCR1-230ENST00000513222 511 ntTSL 418.51■□□□□ 0.551e-8■■□□□ 11.6
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