Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms