Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RBBP7Q16576 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RBBP7Q16576 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms