Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MTHFRP42898 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms