Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SOBPA7XYQ1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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