Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF2Q9Y5W3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF2Q9Y5W3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLF2Q9Y5W3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLF2Q9Y5W3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLF2Q9Y5W3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF2Q9Y5W3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLF2Q9Y5W3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLF2Q9Y5W3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms