Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNRC6BQ9UPQ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNRC6BQ9UPQ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNRC6BQ9UPQ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNRC6BQ9UPQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms