Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PADI4Q9UM07 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PADI4Q9UM07 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PADI4Q9UM07 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms