Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MED23Q9ULK4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
MED23Q9ULK4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MED23Q9ULK4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MED23Q9ULK4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms