Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DENND2AQ9ULE3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DENND2AQ9ULE3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DENND2AQ9ULE3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DENND2AQ9ULE3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DENND2AQ9ULE3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms