Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MBD1Q9UIS9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MBD1Q9UIS9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MBD1Q9UIS9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms