Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM8A1Q9UBU6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM8A1Q9UBU6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM8A1Q9UBU6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM8A1Q9UBU6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms