Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
CHPF2Q9P2E5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CHPF2Q9P2E5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CHPF2Q9P2E5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHPF2Q9P2E5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms