Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
THUMPD1Q9NXG2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
THUMPD1Q9NXG2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms