Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC6A13Q9NSD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC6A13Q9NSD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC6A13Q9NSD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms