Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GKN1Q9NS71 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GKN1Q9NS71 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms