Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRDE2Q9H7Z3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRDE2Q9H7Z3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NRDE2Q9H7Z3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms